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以全轉錄基因體學解析不飽和醛類對於海洋矽藻逆境生理調控之影響
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全球變遷對西北太平洋臺灣海域海洋生物地球化學與生態系統影響之長期觀測與研究(Ⅱ)---子計畫：全球變遷因子對東海及西北太平洋黑潮海域浮游植物生態之影響：以原位雜合顯示細胞在分子層次之反應
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全球變遷對西北太平洋臺灣海域海洋生物地球化學與生態系統影響之長期觀測與研究(Ⅱ)---總計畫及子計畫：全球變遷因子對東海及西北太平洋黑潮海域基礎生產力變動之影響
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全球變遷對西北太平洋臺灣海域海洋生物地球化學與生態系統影響之長期觀測與研究(Ⅱ)---子計畫：全球變遷因子對東海及西北太平洋黑潮海域微生物能量傳遞之影響：混營性鞭毛蟲 (著鞭毛藻)攝食行為
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全球變遷對西北太平洋臺灣海域海洋生物地球化學與生態系統影響之長期觀測與研究(Ⅱ)---子計畫：全球變遷因子對東海及西北太平洋黑潮海域超微真核浮游植物細胞分子生理與族群演替之影響
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全球變遷對西北太平洋臺灣海域海洋生物地球化學與生態系統影響之長期觀測與研究(Ⅱ)---子計畫：全球變遷因子對東海及西北太平洋黑潮海域碳酸鹽系統變動之影響:以東沙環礁為例
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海洋科學與人類生活
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全球變遷對西北太平洋臺灣海域海洋生物地球化學與生態系統影響之長期觀測與研究(Ⅱ)---子計畫：全球變遷因子對東海及西北太平洋黑潮海域碳酸鹽系統變動之影響:以東沙環礁為例
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全球變遷對西北太平洋臺灣海域海洋生物地球化學與生態系統影響之長期觀測與研究(Ⅱ)---子計畫：全球變遷因子對東海及西北太平洋黑潮海域微生物能量傳遞之影響：混營性鞭毛蟲 (著鞭毛藻)攝食行為
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颱風與內波對南海北部生物地球化學作用之衝擊-子計畫：颱風與內波對南海北部海氣二氧化碳交換通量之影響
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海研二號研究船貴重儀器使用中心補助計畫
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我國漁業產業經營與行銷之研究-我國大宗養殖水產品運銷通路及本益調查研究
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南太平洋長鰭鮪資源研究
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寶石珊瑚漁業漁獲資料分析及漁場調查研究
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預防、嚇阻與消除非法、無報告及不受規範漁捕行為之近期發展：船籍國效能之研究
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台灣北部海域斑竹狗鮫之攝食生態、移動、成長與資源評估研究
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石斑魚產銷模式與國際競爭力之研究
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台灣北部海域斑竹狗鮫之攝食生態、移動、成長與資源評估研究
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東海南部鎖管物種之漁業生物學研究
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生態系服務給付機制之研究－臺灣西南沿海養殖漁業的可行性評估
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宜蘭利澤地區深層地熱發電研究( II )
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臺灣離岸風場周邊海域多元使用之管理制度與經濟效益評估
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時空分析漁業生物多樣性以界定台灣北部海洋保護區
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臺灣北部沿海空間規劃策略分析
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海洋教育網站建構與應用之研究
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