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以生物記錄儀配合洋流資訊來了解海龜洄游行為與海況間的關係(Ⅳ)
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全球變遷對西北太平洋臺灣海域海洋生物地球化學與生態系統影響之長期觀測與研究(Ⅱ)---子計畫：河川輸出與營養鹽躍層對矽藻核酸含量和族群生長之影響
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白蝦造血組織專一性表現基因LP5之研究
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淺海熱泉作為氣候變遷現象之模板：生物多樣性和海洋資源之永續合作研究、保育、教育倡議-龜山島熱泉對橈足類生態、螃蟹生理及珊瑚與十足目共生之效應：熱泉生態系之永續發展研究(I)
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海洋酸化對烏魚(Mugil cephalus)生殖生理的影響
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臺灣紅樹林海生疫病菌多樣性、親源關係以及產脂肪酸能力之探討
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長額蝦總科之分類與演化親緣關係研究
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矽藻在海洋酸化狀態下的氮磷吸收基因表現與全蛋白質體分析
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全球暖化對東海南緣水域浮游動物群聚結構衝擊之研究
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以生物記錄儀配合洋流資訊來了解海龜洄游行為與海況間的關係 (III)
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復育基隆海岸生物多樣性－基隆地區近岸海洋生物多樣性評估及海洋生態復育重點規劃－基隆地區大型底棲海藻多樣性組成時空變化及生態復育( II )
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復育基隆海岸生物多樣性－基隆地區近岸海洋生物多樣性評估及海洋生態復育重點規劃－基隆地區海域魚類多樣性組成與群聚時空變化評析與資料庫的建置( II )
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白點症病毒致病機轉：蝦葡萄醣通道蛋白Glut1於病毒感染過程中角色之探討
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復育基隆海岸生物多樣性－基隆地區近岸海洋生物多樣性評估及海洋生態復育重點規劃－基隆地區海域之底棲無脊椎動物群聚時空變化評析 (II)
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全球變遷對西北太平洋臺灣海域海洋生物地球化學與生態系統影響之長期觀測與研究 (I)－子計畫：全球變遷因子對東海及西北太平洋黑潮海域矽藻營養鹽限制之影響 (III)
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龜山島海底熱泉之高溫與低酸鹼度海水對烏龜怪方蟹與海域浮游動物之生理適應機制及毒性反應的影響之研究
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西太平洋海洋紅藻造礁珊瑚藻多樣性及生物地理起源探討
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復育基隆海岸生物多樣性-基隆地區近岸海洋生物多樣性評估及海洋生態復育重點規劃－基隆地區海域魚類多樣性組成與群聚時空變化評析與資料庫的建置(I)
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全球變遷對西北太平洋臺灣海域海洋生物地球化學與生態系統影響之長期觀測與研究(I)-子計畫：全球變遷因子對東海及西北太平洋黑潮海域珊瑚礁區魚類群聚之影響與海洋仔稚魚分子鑑定之研究
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復育基隆海岸生物多樣性－基隆地區近岸海洋生物多樣性評估及海洋生態復育重點規劃－基隆地區大型底棲海藻多樣性組成時空變化及生態復育(I)
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海產爬行蝦類之分類與演化親緣關係研究
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全球變遷對西北太平洋臺灣海域海洋生物地球化學與生態系統影響之長期觀測與研究(I)-子計畫：全球變遷因子對東海及西北太平洋黑潮海域矽藻營養鹽限制之影響(II)
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海洋性真紅藻多樣性、分子親源關係以及生物地理學研究 -以來自太平洋－印度洋藻種為主
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白蝦造血相關基因之鑑定及其功能分析
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矽藻在種間競爭狀態下的氮磷吸收基因表現與全蛋白質體分析
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